Actualmente existen en Alcalá, tras el cierre en 2021 del Albéniz -técnicamente integrado en el Isidra de Guzmán-, un total de catorce institutos de enseñanza media (IES en la terminología oficial), a los que hay que sumar la Escuela de Hostelería, que tiene también categoría de IES. Esta cifra contrasta fuertemente con el único instituto -el Complutense- que hubo en la ciudad durante muchos años. El segundo centro por antigüedad fue la desaparecida Universidad Laboral, cuyo edificio ocupa hoy el Antonio Machado. El más reciente de todos, por ahora, es el Francisca de Pedraza todavía a medio gas, pero ya se sabe que para los políticos que nos gobiernan la educación no siempre es necesariamente lo más urgente.

En lo que respecta a los centros privados son un total de doce, once concertados y uno sin concertar, los que imparten la enseñanza secundaria obligatoria. Esta oferta se amplía al bachillerato en cinco de los concertados y en el no concertado, y existe por último un centro (Las Naves) cuya oferta docente cubre exclusivamente la formación profesional.

Centros públicos *
Nombre		Dirección
Alkalá-Nahar		Ávila, 1
Alonso de Avellaneda		Vitoria,3
Alonso Quijano		Paseo de las Moreras, 1
Antonio Machado		Alalpardo, s/n
Arquitecto Pedro Gumiel		Loeches, 1
Atenea		Río Arlanza, 34
Cardenal Cisneros		Cardenal Sandoval y Rojas, 1
Complutense		Valladolid, 1
Doctor Marañón		Alejo Carpentier, 1
Francisca de Pedraza		Avenida de Europa, s/n
Ignacio Ellacuría		Senda Perdida, s/n
Isidra de Guzmán		Gardenia, 29
Lázaro Carreter		Pío Baroja, 7
Mateo Alemán		Avenida del Ejército, 89
Escuela de Hostelería y Turismo		Camino de la Esgaravita, s/n

^* Todos los institutos de enseñanza media, excepto la Escuela de Hostelería, imparten la ESO y el bachillerato. Los institutos señalados con el icono ( ) imparten también Formación Profesional (la Escuela de Hostelería sólo este nivel educativo).

Centros concertados **
Nombre		Dirección
Alborada		Alejo Carpentier, 27
Calasanz		Santiago, 29
Escuelas Pías		Avenida Lope de Figueroa, 27
Gredos San Diego Alcalá		Octavio Paz, 29
Lope de Vega		Luis de Medina, 12
Minerva		Batalla de Lepanto, 1
Las Naves. Salesianos Alcalá		Río Tajuña, 2
Sagrado Corazón de Jesús		Escritorios, 6
San Gabriel		Avenida de los Pasionistas, s/n
San Ignacio de Loyola		Concepción Arenal, 3
San Joaquín y Santa Ana		Santander, 1
Santa María de la Providencia		Huertas, 4

Centros no concertados **
Nombre		Dirección
Santo Tomás de Aquino		Camino del Molino, s/n (Camarma de Esteruelas)

^** Todos los centros concertados, excepto Las Naves, imparten la ESO. Los señalados con el icono ( ) imparten tambiéns bachillerato. Las Naves imparte únicamente formación profesional ( ). El colegio Santo Tomás de Aquino imparte ESO y bachillerato.